Neuroproteómica clínica

Combinar nuestro expertise tecnológico con análisis bioinformáticos ad-hoc que permitan una mayor comprensión de la neurodegeneración, generando nuevas hipótesis de trabajo. Para ello, aplicaremos análisis tipo Biología de Sistemas, análisis de pathways y generación de interactomas de interés desde un punto de vista neuropatológico.
El aplicar estos flujos de análisis dirigidos nos permitirá definir si algún feature diferencial:
i) es interactor de sustratos neuropatológicos (SNCA, APP, MAPT, TDP43, etc)
ii) participa en ontología sináptica
iii) tiene capacidad de ser secretable a vesículas extracelulares o biofluídos
iv) se ha propuesto anteriormente como potencial biomarcador en temática neurodegenerativa.
Consideramos que esta información es de alto valor añadido a la hora de valorar la traslacionalidad de experimentación multi-ómica en neurodegeneración a la práctica clínica, así como diseñar enfoques terapéuticos innovadores.

La Unidad de Neuroproteómica Clínica de Navarrabiomed-IDISNA se constituyó en el año 2013. Inicialmente, el laboratorio comenzó su andadura realizando caracterizaciones proteómicas mediante nanoLC-MS/MS de estructuras cerebrales humanas relevantes en neuropatología humana como el bulbo olfatorio (Fernández-Irigoyen J et al. J. Proteomics 2012), la amígdala (Fernández-Irigoyen J et al. Front Cell Neurosci 2014), núcleo estriado y globo pálido (Fernández-Irigoyen J et al. Mol Brain 2014), sustancia negra y núcleo basal de Meynert (Fernández-Irigoyen J et al. J. Proteomics 2015). En los últimos años, nuestra actividad se centra en la utilización de flujos multi-ómicos para monitorizar rutas metabólicas y vías de señalización que permitan aumentar el conocimiento del proceso neurodegenerativo tanto en modelos animales de enfermedad como en muestras humanas. Durante el periodo 2017-2020, nuestro laboratorio ha sido el responsable del Programa de Trastornos Neurológicos asociado al Proyecto Proteoma Humano dentro de la Plataforma de Proteómica (Proteored-ISCIII) vinculada a la Plataforma de Recursos Biomoleculares y Bioinformáticos del ISCIII. A día de hoy, nuestro laboratorio forma parte del Human Brain Proteome Project, Global Consortium for Chemosensory Research y la Red Olfativa Española.