Neuroproteómica clínica
INFORMACIÓN DE CONTACTO
Grupo de Investigación
SANTAMARIA MARTINEZ, ENRIQUE
Combinar nuestro expertise tecnológico con análisis bioinformáticos ad-hoc que permitan una mayor comprensión de la neurodegeneración, generando nuevas hipótesis de trabajo. Para ello, aplicaremos análisis tipo Biología de Sistemas, análisis de pathways y generación de interactomas de interés desde un punto de vista neuropatológico.
El aplicar estos flujos de análisis dirigidos nos permitirá definir si algún feature diferencial:
i) es interactor de sustratos neuropatológicos (SNCA, APP, MAPT, TDP43, etc)
ii) participa en ontología sináptica
iii) tiene capacidad de ser secretable a vesículas extracelulares o biofluídos
iv) se ha propuesto anteriormente como potencial biomarcador en temática neurodegenerativa.
Consideramos que esta información es de alto valor añadido a la hora de valorar la traslacionalidad de experimentación multi-ómica en neurodegeneración a la práctica clínica, así como diseñar enfoques terapéuticos innovadores.
La Unidad de Neuroproteómica Clínica de Navarrabiomed-IDISNA se constituyó en el año 2013. Inicialmente, el laboratorio comenzó su andadura realizando caracterizaciones proteómicas mediante nanoLC-MS/MS de estructuras cerebrales humanas relevantes en neuropatología humana como el bulbo olfatorio (Fernández-Irigoyen J et al. J. Proteomics 2012), la amígdala (Fernández-Irigoyen J et al. Front Cell Neurosci 2014), núcleo estriado y globo pálido (Fernández-Irigoyen J et al. Mol Brain 2014), sustancia negra y núcleo basal de Meynert (Fernández-Irigoyen J et al. J. Proteomics 2015). En los últimos años, nuestra actividad se centra en la utilización de flujos multi-ómicos para monitorizar rutas metabólicas y vías de señalización que permitan aumentar el conocimiento del proceso neurodegenerativo tanto en modelos animales de enfermedad como en muestras humanas. Durante el periodo 2017-2020, nuestro laboratorio ha sido el responsable del Programa de Trastornos Neurológicos asociado al Proyecto Proteoma Humano dentro de la Plataforma de Proteómica (Proteored-ISCIII) vinculada a la Plataforma de Recursos Biomoleculares y Bioinformáticos del ISCIII. A día de hoy, nuestro laboratorio forma parte del Human Brain Proteome Project, Global Consortium for Chemosensory Research y la Red Olfativa Española.
Sola-Sevilla, N, Garmendia-Berges, M, Aleixo, M, Mera-Delgado, M, Solas, M, Tordera, RM, García-Carracedo, L, Expósito, S, Fernández-Irigoyen, J, Anaya-Cubero, E, Guruceaga, E, Santamaria, E, Martin, ED, Puerta, E
"Microglial SIRT2 deficiency aggravates cognitive decline and amyloid pathology in Alzheimer's disease".
Brain Behav. Immun.. 129: 223 - 243. 2025. [doi:10.1016/j.bbi.2025.06.016]
Cartas-Cejudo, P, Cortés, A, Lachén-Montes, M, Anaya-Cubero, E, Fernández-Irigoyen, J, Santamaría, E
"Data-driven drug repositioning using olfactory omics profiles: challenges and perspectives in neurodegeneration.".
Neural Regen. Res.. 20(7): 1997 - 1998. 2025. [doi:10.4103/NRR.NRR-D-24-00334]
Gutiérrez, M, Zamora, I, Iriarte, R, Pajares, MJ, Yang, Q, Qian, C, Otegui, N, Fernández-Irigoyen, J, Santamaria, E, Alcala, N, Sexton-Oates, A, Fernandez-Cuesta, L, Barajas, M, Calvo, A, Montuenga, LM, Knudsen, B, You, SY, Freeman, MR, Encio, I, Rotinen, M
"ONECUT2 reprograms neuroendocrine fate and is an actionable therapeutic target in small cell lung cancer".
Mol. Med.. 31(1): 232. 2025. [doi:10.1186/s10020-025-01267-6]
Cortés A, Phung TK, de Mena L, Garrido A, Infante J, Ruíz-Martínez J, Galmés-Ordinas MÀ, Glendinning S, Pérez J, Roig A, Soto M, Cosgaya M, Ravasi V, Fernández M, Rubiano-Castro A, Díaz R, Hernández-Eguiazu H, Sánchez-Quintana C, Vinagre-Aragón A, Mondragón E, Croitoru I, Rivera-Sánchez M, Corrales-Pardo A, Sierra M, Tolosa E, Malagelada C, Nirujogi RS, Fernández-Irigoyen J, Santamaría E, Alessi DR, J Martí M, Ezquerra M, Fernández-Santiago R
"In-depth mass-spectrometry reveals phospho-RAB12 as a blood biomarker of G2019S LRRK2-driven Parkinson's disease.".
Brain. 148(6): 2075 - 2092. 2025. [doi:10.1093/brain/awae404]
Marques, J, Santamaria, E, Ainzua, JFIE, Cortes, A, Aymerich, MS, Orbe, J, Zalba, G
"NADPH oxidase 5 overexpression in endothelial cells influences the development of atherothrombotic stroke".
Free Radic. Biol. Med.. 233. 2025. [doi:10.1016/j.freeradbiomed.2025.05.094]
Izco, M, Sola, C, Schleef, M, Schmeer, M, de Toro, M, Verona, G, Carlos, E, Reinares-Sebastian, A, Colina, S, Marzo-Sola, ME, Garcia-Sanmartin, J, Fernández-Irigoyen, J, Santamaria, E, Mugica-Vidal, R, Blesa, J, Alvarez-Erviti, L
"Development of human targeted extracellular vesicles loaded with shRNA minicircles to prevent parkinsonian pathology".
Transl. Neurodegener.. 14(1): 26. 2025. [doi:10.1186/s40035-025-00484-7]
Izco-Cubero, M, Zambom-Ferraresi, F, Zambom-Ferraresi, F, de la Riva, MLFG, Santamaría, E, Fernandez-Irigoyen, J, Lachén-Montes, M, Lasarte, JJ, Uzcanga-Lacabe, M, Fernandez, S, San Martin, GS, Maraví-Aznar, E, Martinez-Velilla, N
"Impact of medication use on olfactory performance in older adults".
Front. Public Health. 13: 1554459. 2025. [doi:10.3389/fpubh.2025.1554459]
Anaya-Cubero, E, Cartas-Cejudo, P, De Miguel, M, Extramiana, L, Romero-Murillo, S, Lachén-Montes, M, Fernández-Irigoyen, J, Santamaria, E
"Proteomic interrogation of the human olfactory system: the road ahead".
Expert Rev. Proteomics. 22(3): 85 - 88. 2025. [doi:10.1080/14789450.2025.2476966]
Echepare M, Picabea B, Arricibita A, Teijeira Á, Pasquier A, Zandueta C, Otegui N, Santamaría E, Fernández-Irigoyen J, Romero O, Sanchez-Cespedes M, Lecanda F, Hernández J, Felip E, Cruz-Bermúdez A, Provencio M, Gentili M, Facchinetti F, Roz L, Montuenga LM, Valencia K
"DSTYK Inhibition Sensitizes NSCLC to Taxane-Based Chemotherapy.".
J. Thorac. Oncol.. 20(3): 345 - 365. 2025. [doi:10.1016/j.jtho.2024.11.003]
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