Neuroproteómica clínica
INFORMACIÓN DE CONTACTO
Grupo de Investigación
SANTAMARIA MARTINEZ, ENRIQUE
Combinar nuestro expertise tecnológico con análisis bioinformáticos ad-hoc que permitan una mayor comprensión de la neurodegeneración, generando nuevas hipótesis de trabajo. Para ello, aplicaremos análisis tipo Biología de Sistemas, análisis de pathways y generación de interactomas de interés desde un punto de vista neuropatológico.
El aplicar estos flujos de análisis dirigidos nos permitirá definir si algún feature diferencial:
i) es interactor de sustratos neuropatológicos (SNCA, APP, MAPT, TDP43, etc)
ii) participa en ontología sináptica
iii) tiene capacidad de ser secretable a vesículas extracelulares o biofluídos
iv) se ha propuesto anteriormente como potencial biomarcador en temática neurodegenerativa.
Consideramos que esta información es de alto valor añadido a la hora de valorar la traslacionalidad de experimentación multi-ómica en neurodegeneración a la práctica clínica, así como diseñar enfoques terapéuticos innovadores.
La Unidad de Neuroproteómica Clínica de Navarrabiomed-IDISNA se constituyó en el año 2013. Inicialmente, el laboratorio comenzó su andadura realizando caracterizaciones proteómicas mediante nanoLC-MS/MS de estructuras cerebrales humanas relevantes en neuropatología humana como el bulbo olfatorio (Fernández-Irigoyen J et al. J. Proteomics 2012), la amígdala (Fernández-Irigoyen J et al. Front Cell Neurosci 2014), núcleo estriado y globo pálido (Fernández-Irigoyen J et al. Mol Brain 2014), sustancia negra y núcleo basal de Meynert (Fernández-Irigoyen J et al. J. Proteomics 2015). En los últimos años, nuestra actividad se centra en la utilización de flujos multi-ómicos para monitorizar rutas metabólicas y vías de señalización que permitan aumentar el conocimiento del proceso neurodegenerativo tanto en modelos animales de enfermedad como en muestras humanas. Durante el periodo 2017-2020, nuestro laboratorio ha sido el responsable del Programa de Trastornos Neurológicos asociado al Proyecto Proteoma Humano dentro de la Plataforma de Proteómica (Proteored-ISCIII) vinculada a la Plataforma de Recursos Biomoleculares y Bioinformáticos del ISCIII. A día de hoy, nuestro laboratorio forma parte del Human Brain Proteome Project, Global Consortium for Chemosensory Research y la Red Olfativa Española.
Cartas-Cejudo, P, Cortés, A, Lachén-Montes, M, Anaya-Cubero, E, Fernández-Irigoyen, J, Santamaría, E
"Data-driven drug repositioning using olfactory omics profiles: challenges and perspectives in neurodegeneration".
Neural Regen. Res.. 20(7): 1997 - 1998. 2025. [doi:10.4103/NRR.NRR-D-24-00334]
Gelpi, E, Reinecke, R, Gaig, C, Iranzo, A, Sabater, L, Molina-Porcel, L, Aldecoa, I, Endmayr, V, Högl, B, Schmutzhard, E, Poewe, W, Pfausler, B, Popovic, M, Pretnar-Oblak, J, Leypoldt, F, Matschke, J, Glatzel, M, Erro, EM, Jerico, I, Caballero, MC, Zelaya, MV, Mariotto, S, Heidbreder, A, Kalev, O, Weis, S, Macher, S, Berger-Sieczkowski, E, Ferrari, J, Reisinger, C, Klupp, N, Tienari, P, Rautila, O, Niemelä, M, Yilmazer-Hanke, D, Guasp, M, Bloem, B, Van Gaalen, J, Kusters, B, Titulaer, M, Fransen, NL, Santamaria, J, Dawson, T, Holton, JL, Ling, H, Revesz, T, Myllykangas, L, Budka, H, Kovacs, GG, Lewerenz, J, Dalmau, J, Graus, F, Koneczny, I, Höftberger, R
"Neuropathological spectrum of anti-IgLON5 disease and stages of brainstem tau pathology: updated neuropathological research criteria of the disease-related tauopathy".
Acta Neuropathol.. 148(1): 53. 2024. [doi:10.1007/s00401-024-02805-y]
Aparicio, P, Navarrete-Villanueva, D, Gómez-Cabello, A, López-Royo, T, Santamaría, E, Fernández-Irigoyen, J, Ausín, K, Arruebo, M, Sebastian, V, Vicente-Rodríguez, G, Osta, R, Manzano, R
"Proteomic profiling of human plasma extracellular vesicles identifies PF4 and C1R as novel biomarker in sarcopenia".
J. Cachexia Sarcopenia Muscle. 15(5): 1883 - 1897. 2024. [doi:10.1002/jcsm.13539]
Lozano-Vicario, L, Muñoz-Vázquez, AJ, Cedeno-Veloz, BA, Romero-Ortuno, R, Galbete, A, Fernández-Irigoyen, J, Santamaría, E, Zambom-Ferraresi, F, Ortiz-Gómez, JR, Hidalgo-Ovejero, AM, Martínez-Velilla, N
"The role of C-reactive protein as a risk marker of postoperative delirium in older hip fracture patients: a prospective cohort study".
Eur. Geriatr. Med.. . 2024. [doi:10.1007/s41999-024-01046-2]
Torres, P, Rico-Rios, S, Ceron-Codorniu, M, Santacreu-Vilaseca, M, Seoane-Miraz, D, Jad, Y, Ayala, V, Mariño, G, Beltran, M, Miralles, MP, Andrés-Benito, P, Fernandez-Irigoyen, J, Santamaria, E, López-Otín, C, Soler, RM, Povedano, M, Ferrer, I, Pamplona, R, Wood, MJA, Varela, MA, Portero-Otin, M
"TDP-43 regulates LC3ylation in neural tissue through ATG4B cryptic splicing inhibition".
Acta Neuropathol.. 148(1): 45. 2024. [doi:10.1007/s00401-024-02780-4]
Campoy-Campos, G, Solana-Balaguer, J, Guisado-Corcoll, A, Chicote-González, A, Garcia-Segura, P, Pérez-Sisqués, L, Torres, AG, Canal, M, Molina-Porcel, L, Fernández-Irigoyen, J, Santamaria, E, de Pouplana, LR, Alberch, J, Marti, E, Giralt, A, Pérez-Navarro, E, Malagelada, C
"RTP801 interacts with the tRNA ligase complex and dysregulates its RNA ligase activity in Alzheimer's disease".
Nucleic Acids Res.. 52(18): 11158 - 11176. 2024. [doi:10.1093/nar/gkae776]
Chocarro, L, Blanco, E, Fernandez-Rubio, L, Garnica, M, Zuazo, M, Garcia, MJ, Bocanegra, A, Echaide, M, Johnston, C, Edwards, CJ, Legg, J, Pierce, AJ, Arasanz, H, Fernandez-Hinojal, G, Vera, R, Ausin, K, Santamaria, E, Fernandez-Irigoyen, J, Kochan, G, Escors, D
"PD-1/LAG-3 co-signaling profiling uncovers CBL ubiquitin ligases as key immunotherapy targets".
EMBO Mol. Med.. 16(8): 1791 - 1816. 2024. [doi:10.1038/s44321-024-00098-y]
Matilla, L, Martín-Núñez, E, Navarro, A, Garaikoetxea, M, Fernández-Celis, A, Goñi-Olóriz, M, Gainza, A, Fernández-Irigoyen, J, Santamaría, E, Tamayo, I, Alvarez, V, Sádaba, R, Jover, E, López-Andrés, N
"Neuropilin-1 sex-dependently modulates inflammatory, angiogenic and osteogenic phenotypes in the calcifying valve interstitial cell".
Biochem. Pharmacol.. 226: 116336. 2024. [doi:10.1016/j.bcp.2024.116336]
Lozano-Vicario, L, Zambom-Ferraresi, F, Zambom-Ferraresi, F, de Asteasu, MLS, Galbete-Jiménez, A, Muñoz-Vázquez, AJ, Cedeno-Veloz, BA, De la Casa-Marín, A, Ollo-Martínez, I, Fernández-Irigoyen, J, Santamaría, E, Elcano, RS, Ortiz-Gómez, JR, Romero-Ortuño, R, Izquierdo, M, Martínez-Velilla, N
"Effects of Exercise Intervention for the Management of Delirium in Hospitalized Older Adults: A Randomized Clinical Trial".
J. Am. Med. Dir. Assoc.. 25(8): 104980. 2024. [doi:10.1016/j.jamda.2024.02.018]
Solana-Balaguer, J, Garcia-Segura, P, Campoy-Campos, G, Chicote-González, A, Fernández-Irigoyen, J, Santamaría, E, Pérez-Navarro, E, Masana, M, Alberch, J, Malagelada, C
"Motor skill learning modulates striatal extracellular vesicles' content in a mouse model of Huntington's disease".
Cell Commun. Signal.. 22(1): 321. 2024. [doi:10.1186/s12964-024-01693-9]
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